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重大突破 | Factorial Bio与沃奇酶科合作创新的细胞内建库技术,推动单细胞测序的临床转化
来源: | 作者:沃小森 | 发布时间: 2023-07-25 | 161 次浏览 | 分享到:

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沃奇酶科 博尔德 电讯 - 

总部位于美国加利福尼亚州的创新单细胞测序公司 Factorial Biotechnologies(factorial.bio)日前宣布与 Watchmaker Genomics 达成一项举世瞩目的合作。本次合作旨在联合开发一种全新的、突破性的单细胞测序建库技术,来满足日益挑战的临床需求。

众所周知,单细胞测序技术一经问世就引起了产学研界的广泛关注和应用,这种突破性的高分辨率的测序技术已经协助研究者们探索和攻克了许多棘手的科学和临床难题,比如肿瘤异质性的成因和演化、靶向治疗的耐药机制和标志物、微小残留病(MRD)的监测、细胞或基因治疗药物的开发和临床安全性评价等。与传统高通量测序(NGS)技术不同的是,单细胞测序技术可以实现亚克隆水平的基因组学及多组学联合应用,可把突变检测、表观特征、基因表达和蛋白分析的精度提高到单个细胞的水平,从而在宏观和微观两个角度发现细胞间、组织间、时间以及空间上的细微差别,阐述和总结这些异质性的由来及演变规律将有助于从中寻找到可服务于临床的精准诊疗方法。

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图:单细胞测序和NGS的比较,前者(左)的分析精度可达单个细胞水平,从而为研究者提供微观视角,研究样品间的异质性问题,好比采用数字信号的显示屏比传统模拟信号屏拥有更高的解析度,给研究者提供针对样品的“超清画面”。

随着技术的日新月异,单细胞测序已经证明了其在临床领域的巨大应用价值和商业潜力,可帮助医生发现许多NGS无法检测到但又非常关键的信息,从而提高诊断和治疗水平,减少患者的痛苦并延长他们的寿命。尤其在辅助生殖、肿瘤和感染性疾病的诊疗方面,单细胞测序可分析微量胚胎中的基因组变异,病理组织中的克隆结构、共突变事件和免疫微环境,不仅提高了少见突变的检测灵敏度和准确度,还可实现对特定克隆的准确鉴别和追踪,揭示其进化谱系、标志物特征和调控网络,为精准的用药指导、疾病监测和生物药开发奠定坚实的基础。

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图:Factorial Bio 致力于推动单细胞测序技术在临床领域的应用革命。

然而,要想真正实现这个宏伟愿景,推动单细胞技术的临床落地并非易事。由于单细胞测序的样品前处理相较NGS更为复杂和严格,因此局限了其在医院场景下的应用普及,也推高了检测成本,成为了单细胞技术临床化的*大绊脚石。相比NGS,单细胞测序需要先进行组织解离、单细胞分选和富集,然后基于微流控或微孔技术进行单个细胞的捕获和体外建库(经历单细胞裂解、核酸释放、核酸分子标记以及文库制备等步骤),*后才能像普通NGS那样把所有单细胞文库进行混合、质控和上机测序(下图)。这个过程中,单细胞的分离、标记和建库技术对仪器和试剂的灵敏度、准确度和稳定性都有非常严苛的要求,可谓单细胞测序的核心竞争力。

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图:单细胞测序的工作流程。

Factorial Bio 正是基于这样的市场背景和需求,接过了克服上述挑战的接力棒,他们与 Watchmaker 一起紧密合作,开发了一种颠覆性的细胞内建库技术(In-cell Single-cell Library Prep),名为 CELLseq,凭借其无与伦比的成本和便利性优势,将引领单细胞全基因组测序(scWGS)、靶向测序(scTS)以及多组学测序(scDNA-Seq + scRNA-Seq)的临床转化和落地。

图:Factorial Bio 和 Watchmaker 合作开发了一种全新的细胞内建库技术。

在细胞内制备测序文库可避免单细胞工作流程中细胞分离和捕获的繁琐步骤,因此CELLseq在缩短全流程时间、提高流程便利性、扩展终端应用、降低综合成本等方面具有显著的优势,且测序结果的数据质量和稳定性可媲美传统的Bulk NGS。“Factorial Bio 的细胞内文库制备技术为单细胞应用的临床转化提供了一种经济且强大的解决方案,具有广阔的前景,这与当前市场上的其他单细胞测序产品都有本质上的区别。” Watchmaker 的联合创始人兼首席执行官 Trey Foskett 如是说。

CELLseq的细胞内文库制备方法学是一种突破性的全新技术,因此需要使用高度进化且性能稳定的专用酶来构建整个生物化学反应体系,这就是 Watchmaker 的用武之地。“我们的CELLseq方法学需要高灵敏度、高稳定性和高精度的酶,以保证卓越的性能和始终一致的结果。” Factorial Bio 的联合创始人兼首席执行官 John Wells 说道,“我们与 Watchmaker 的合作使我们能够获得一流的酶及其团队的专业知识,从而加速我们细胞内文库制备技术的产品化。”

本次合作的意义是在降低成本、简并复杂流程、克服起始样品挑战(如极微量的起始体积或稀有的细胞克隆)和多元化终点输出(如靶向测序、转录组测序和全基因组测序)等方面显著扩大单细胞测序的临床可及性,从而以前所未有的规模实现新的单细胞多组学临床应用。Watchmaker 和 Factorial Bio 共同畅想了一个可及且美好的精准医学的未来图景,即:几乎任何临床测序都可达到单细胞级别的高清解析度,这将深刻改变整个产业的生态和价值链。“我们很高兴能参与到这样一个伟大的合作项目中,开发一种革命性的技术,帮助用户获得能全面、真实地表征样品所有生物学特征的大数据,迎接生命数字化时代的到来。” Foskett 说道。

想了解有关这项技术的更多信息,请访问 Factorial.bio 并订阅更新。

关于 Factorial Biotechnologies

Factorial Biotechnologies 是一家专注创新单细胞测序解决方案的公司,开发了一种新型的单细胞胞内文库制备技术CELLseq,旨在以更低的成本、更简便的流程、更多元化的应用生态来推动单细胞技术的临床转化,从而提升整个精准医学领域的诊疗水平,*终使患者获益。Factorial Biotechnologies 总部位于美国加利福尼亚州圣卡洛斯市,由 John Wells 和 Katie Zobeck 博士共同创立,核心团队具备多年的NGS硬件、文库制备和生物信息学方面的专业知识及经验。

关于沃奇酶科(Watchmaker Genomics)

沃奇酶科(Watchmaker Genomics)是一家专注提供分子酶与基因组学创新解决方案的企业。结合领先的酶工程、酶设计与酶生产技术,我们获得了一系列专为体外诊断和生物医药应用而开发的分子酶,并优化整合成全流程,可为用户提供分子诊断、生物合成和基因编辑领域的单酶、模块化和全流程产品,并提供个性化开发和生产服务。

沃奇酶科总部位于美国科罗拉多州博尔德市,由 Trey Foskett,Brian Kudlow 和 Stephen Picone 博士共同创立,成员大多来自原Kapa Biosystems,Enzymatics 和 ArcherDx 的核心团队,拥有数十年连续成功创业、将前沿技术工程化以及推进临床基因组学实践的资质和实力。我们真诚地期待与所有创新型生命科学公司、基因组学服务公司和尖端研究型实验室进行合作。

沃奇酶科产品的核心优势是:

  • 对微起始量、降解度高、质量参差的样品表现更佳;

  • 高保真性和灵敏度,减少假阳和假阴结果;

  • 试剂质量和操作流程的稳定性高,数据和结果的偏差较小;

  • 流程简捷,自动化友好;

  • 进口品质,国产价格,供应链高效灵活,定制生产门槛较低;

  • 根据用户个性化需求,提供酶设计和酶进化的委托开发服务。



杭州沃森生物与Watchmaker展开全方位合作。Watchmaker拥有高度严格的酶制作流程,使其酶产品具有更高的溶解度、抗聚集性及稳定性;Watchmaker 产品包含Equinox 高保真文库扩增试剂盒、StellarScript系列逆转录酶、多重高保真PCR 试剂盒、T4 DNA Ligase 等NGS核心分子酶原料。

如需了解更多产品信息,请点击以下链接:

Watchmaker | 基因组装PCR应用

Watchmaker—NGS文库制备核心分子酶原料