TIANGEN mNGS样本提取方案,助力精准病原微生物检测

背景:
分子诊断技术特别是病原宏基因组检测技术(mNGS),在传统病原体诊断、未知新发病原体鉴别、复合感染诊断、耐药诊断、评估人体反应和抗感染疗效评价等方面具有良好应用前景,为感染性疾病的防控提供了重要手段,也促进了临床诊断能力的提升。
mNGS可对患者样品中的微生物和宿主遗传物质(DNA和RNA)进行全面分析,并逐渐由实验室转移至临床应用,作为医生鉴别诊断的部分依据,为客观诊断提供支持。临床实验室中实施mNGS检测,因其含有多种微生物信息,且不乏正常菌群、污染微生物及背景微生物,为*终结果的判读带来挑战。而试剂盒中背景微生物的控制有助于背景微生物数据库的建立,能有效助力mNGS结果的客观判读。
TIANGEN mNGS样本提取方法:

TIANGEN mNGS样本提取方案:



TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取试剂盒NG550,背景核酸有效防控的小量样本病原核酸高效提取,助力精准病原微生物检测!
实验数据:
使用5个批次的TIANGEN病原微生物提取试剂盒(S1-S5)及3款对照试剂盒(C1-C3)提取8 ng的模拟宿主(Arachis hypogaea)基因组DNA,取1 ng 所得DNA使用TIANSeq DirectFast Library Kit(NG101)构建测序文库, illumina平台Paired-End 150测序,每批试剂盒设置2个平行。所得数据经质控、过滤宿主序列后,进行物种注释。bowtie2比对病原数据库,统计比对reads数量, 计算对应RPM值。
1.有效的背景微生物核酸控制

图1. 背景微生物核酸RPM值差异显著性分析
计算5批次TIANGEN试剂盒提取建库样本(S1-S5)和3个对照试剂盒提取建库样本(C1-C3)中各种背景微生物RPM均值,采用非参数Wilcoxon检验,P-value<0.001,呈现极显著差异。结果表明TIANGEN S1-S5样本中PRM值显著低于对照试剂盒C1-C3。
2. 良好的产品稳定性

图2. TIANGEN S1-S5样本常见病原微生物RPM均值Wilcoxon检验,采用非参数Wilcoxon检验,对TIANGEN S1-S5样本数据中12种潜在背景病原微生物RPM均值的差异显著性检验。结果显示,S1-S5样本间P-value>0.05,无显著差异。表明TIANGEN试剂盒在背景菌控制上表现出了良好的产品稳定性。

图3.常见背景病原微生物RPM均值比较
分析比较TIANGEN试剂盒所提取建库的核酸样本(S1-S5)和对照试剂盒所提取建库的核酸样本(C1-C3)中12种潜在背景病原微生物RPM均值。结果显示,S1- S5中E. coli、 P.Aeruginosa、S. maltophilia较C1-C3组RPM均值降低。

TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取试剂盒(NG550)

产品简介
本试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和独特的缓冲液系统,从血清、血浆、淋巴液、尿液、胸腹水、肺泡灌洗液、脑脊液、唾液、拭子、组织、粪便、痰液、无细胞体液、细胞培养上清液或各种病毒保存液中分离纯化高质量病原微生物DNA/RNA。独特包埋的磁珠,在一定条件下对核酸具有很强的亲和力,而当条件改变时,磁珠释放吸附的核酸,能够达到快速分离纯化核酸的目的。提取的DNA/RNA得率高、纯度高、质量稳定可靠。使用本试剂盒纯化的核酸可适用于各种常规操作,包括反转录、PCR、RT-PCR、荧光定量PCR、NGS等各种下游实验。
产品特点
样本广泛:适用于血浆各种体液样本、组织悬浮液、拭子等样本。
共提取:可同时提取病原微生物的DNA和RNA
高效快速:1 h即可完成整个流程。
高通量:可整合磁棒法自动化仪器或移液法自动化仪器进行高通量提取实验。
杭州沃森生物作为天根生化浙江企业代理商,为大家提供全线天根分子生物学产品及其他多样化合作方式,如有需要,欢迎联系:0571-86495259
订购信息:
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TANMicrobe磁珠法病原微生物DNA/RNA提取试剂盒 | | |
TIANMicrobe磁珠法大体积病原微生物DNA提取试剂盒 | | |
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