
表观遗传学是研究在基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因的表达和调控的可遗传变化的一门遗传学分支学科。表观遗传的现象很多,比如RNA介导的基因沉默,组蛋白修饰,DNA甲基化等。其中,DNA的甲基化作为高等真核生物中一个主要的表观遗传学机制,被广泛研究。

近年来涌现出很多 DNA 甲基化的检测技术,常用的DNA甲基化检测方式主要是基于亚硫酸盐修饰预处理的甲基化检测技术。

(重亚硫酸盐转化原理)
天根生化针对DNA甲基化研究中的DNA重亚硫酸盐转化开发一款全新试剂盒。
DNA重亚硫酸盐快速转化试剂盒(离心柱型)(DP225)
简单快速:转化和纯化流程可在2 h内完成,对仪器设备要求较低,操作简便。
转化率高:DNA样品中未甲基化胞嘧啶转化为尿嘧啶的转化率可达99.5%以上。
反应灵敏:DNA样品适用浓度范围在500 pg~2.5 μg之间。
完整度高:处理后的DNA完整度好,得率高。
普适性好:本试剂盒处理后的DNA样品适用于甲基化特异性PCR,测序法及芯片法等后续甲基化分析方法。
实验流程
重亚硫酸盐转化
1. Bisulfite Mix-L3干粉溶解
2. 重亚硫酸盐反应体系配制
3. 重亚硫酸盐转化循环条件

表1重亚硫酸盐反应体系

表2重亚硫酸盐转化循环条件
重亚硫酸盐处理后的 DNA纯化

DP225 实验案例一
转化时间和转化试剂体积对转化率的影响
DNA重亚硫酸盐转化试剂盒转化率评估实验流程

重亚硫酸盐转化循环条件

转化时间和转化试剂体积对转化率的影响

实验结论:
用天根DNA重亚硫酸盐快速转化试剂盒DP225转化1 μg Human Genome DNA+10 ng λ DNA,比较了不同转化试剂体积(100 μl和120 μl)和不同转化时间(50 min (2 cycles), 75 min (3 cycles)和100 min (4 cycles))对转化率的影响,转化率通过NGS方法评估(流程见上表)。结果显示,转化试剂体积为120 μl时,相比100 μl得到更高的转化率;转化时间为100 min (4 cycles)时 ,相比于更短的转化时间(50 min (2 cycles)和75 min (3 cycles)),得到更高的转化率。
不同品牌的同类产品转化率比较
DNA重亚硫酸盐转化试剂盒转化率评估实验流程

不同品牌的DNA重亚硫酸盐转化试剂盒的转化率比较

实验结论:
用天根DNA重亚硫酸盐快速转化试剂盒DP225和国际主流品牌同类产品转化1 μg Human Genome DNA+10 ng λ DNA,比较各产品的转化率,转化率通过NGS方法评估(流程见上表)。结果显示,DP225具有高的转化率,性能与国际品牌相当甚至更优。
PyroSequencing焦磷酸测序
Sanger测序
建库测序、捕获测序、芯片、panel
甲基化特异性PCR-EM101
高分辨率熔解曲线分析-FP210
探针法qPCR-FP211,FP206