文库构建流程


实验结果


灵活的上样量和片段处理长度
图1. 不同反应时间对DNA 片段化效果
使用“TIANSeq DirectFast DNA Library Prep Kit” 对10 ng 和1000 ng DNA 进行片段化处理。处理不同时长的反应产物经1.8× 磁珠进行纯化后用于Angilent 2100 分析。


片段化酶与机械片段化效果比较
图2. 不同文库制备方案基因组覆盖的对比结果,三种不同GC 含量细菌基因组DNA 等摩尔混合,100 ng 混合DNA 经不同方案制备文库测序后比较基因组覆盖度。结果表明:FEA Module(NG301) 对DNA 的片段化效果与超声破碎高度一致,均不存在碱基偏好性。
样本低至1ng建库效果比较
图3. 不同文库制备方案基因组覆盖的对比结果,三种不同GC 含量细菌基因组DNA 等摩尔混合,1 ng 混合DNA 经不同方案制备文库测序后比较基因组覆盖度。结果表明:即使低至1 ng 的DNA 上样量,FEA Module(NG301) 的片段化效果仍然与 超声破碎方法高度一致,没有碱基偏好性。


采用PCR free步骤测序结果比较
图4. 不同初始量的基因组DNA 使用PCR 或PCR free 的方式进行文库构建,*终的基因组覆盖对比对。结果表明:使用Fragmentation Module (NG301)试剂及一管式操作和高效的文库构建步骤,无论是否进行PCR 富集,所得到的DNA 文库在片段覆盖度分布方面均与机械破碎方法保持高度一致。
文库构建效率与得率统计
图5. 不同起始量样本(1、10、25、50、100、500、1000 ng) 进行文库构建后,使用qPCR 对得到的文库DNA 进行定量分析结果。线性回归分析表明在广泛的上样量范围内,文库得率均呈良好的线性关系。即使在上样量低至1 ng 的情况下,文库构建效率也不会降低。